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YとXの間に転座が起こることは知られていますが、通常の染色体のように頻繁に行われているわけではないようです。
また、Yのみに有る部分は転座の対象にはなりません。また、Yと重複していないXの遺伝子部分も本来は転座の対象にはならない
転座がしやすい遺伝子にレース、ジャパンブルー、プラチナなどがあります。これらはxとYの相同部分にあり尚且つ男性ホルモンを司っている部分から、離れています。逆に近いと転座が起こりにくい遺伝子となりオールドファッションなどのx型が見つかっていない遺伝子が該当します。
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